Hari ke 3

Day 3.

I guess, since I wrote a lot on day 1, it was okay to skip Day 2. So, hi there Day 3.

I had progress meeting with Prof on Friday morning. Presenting my transcriptome data, which I try to analyze it. I know I have something, but I really cant connect all those things yet. It seems like a big out shout of Eureka, but, I just dont know. yet

Prof liked my progress.

Later that day, I met with Dr. G. As usual he gave me another aspect to analyse, up till to say what I did before was rubbish. e re

I really hate Dr. G.

Because he is so good, makes me really intimidated with him.

Apa eh yang dia minta buat? Oh, gabungkan FPKM file dengan Annotated file, kemudian screen for keywords, dan buat line graph to look for pattern.
Buat GSEA guna KOBAS, dan Analyse B2G, B2G untuk data DEG dan Venn Diagram, dan Oh, baca tentang Signal Peptide.

Okay, nanti nak buat list for all of this dan tick one by one yang dah siap.

Bosannya post. Hahahaha

Sebenarnya tengah dok mencari file Blast, yang boleh digabungkan dengan FPKM value. Oh mungkin hari bila bila boleh bercerita tentang NGS, jadi boleh tengok sebenarnya aku ni dah cukup faham ke tentang NGS ni.

Kenapa ye lampi sangat otak ni. Banyak tengok drama Korea maybe.

Nothing much happened on my weekend. Mungkin weekdays nanti lagi seronot. Hahaha.

Oh BTW, Toshiba kembali berfungsi yehuuu. Laptop Toshiba ni sebenarnya Laptop pertama, beli untuk MSB la kohnonnya. Sekali lebih kepada tengok drama korea je. Hahahaha. Suddenly, monitor dia rosak, terbahagi tiga, lepas tu bahagian tu jadi 321, out of 123. Pening nak guna. Tapi memang masa run data NGS tak boleh nak guna laptop tu. Sebab data kan besar besar, memang Toshiba tak mampu nak cater. Nasib baik ada yang ikhlas hati menyumbang Laptop DELL, second hand ni. Boleh lah run data data tu semua.

Cumanya, sebab DELL ni dengan KUbuntu (Ubuntu for Linux yang lebih user friendly). Tak ada Microsoft office. Ingatkan boleh je survive dengan WPS Kingsoft office, sekali WPS datasheet tak boleh plot graf. Sangatlah tak kelakar. Terpaksa guna Libre Office. Nasib baik Libre Office 5 ni dah elok berbanding yang 3 lepas. Kalau tak, memanglah haru biru.

Jadinya, terpaksalah juga try on Toshiba. Install antivirus, scan, ada 40++ file infected. patutla slow, dan penuh masalah. Sebab bila McAfee expired bertahun lepas, memang tak pernah ambil kisah pasal antivirus. Sekali, memang menternak. Lepas scan, cuba execute yang mana infected, walllaaaaa, dia berjaya dengan eloknya. Boleh la nak guna Office.

Masalah sekarang, extended Blast file, tak ada yang full. ada yang annotated je. Grrr. Lepas tu, php yang nak guna untuk nak satukan annotated file dengan un-annotated file tak reti nak guna pulak. Tu la, masa KK tunjuk mata tak laju nak grab command dia guna. Sekarang dah terkapai kapai padan muka.

Oh!

Teringat lagi satu yang Dr. G suruh buat. Check orthoVenn untuk TR80436, kut la ada pairing yang boleh nak buat guna tengok function.

Back to cerita gagal tadi, bila file annotation penuh tak ada, tak boleh nak match kan dengan file FPKM. Tak dapat la guna excel.

So, nak tengok drama Korea dulu malam ni. LOL

Esok macam nak tengok wayang. LOL



Bye. Salam.


Adibah kaki buang masa yang sedang berusaha untuk menjadi lebih baik. LOL